台灣基督長老教會是普世基督教會及改革宗教會大家庭的一份子。它的歷史根源可以上溯至1865年英國長老教會宣教師馬雅各醫生來台在南部及1872年加拿大長老教會宣教師馬偕牧師在北部所開展的宣教工作。1912年宣教師成立台灣大會，讓屬不同母會的南北大會可以共同討論事工。1951年召開會議議決成立今之台灣基督長老教會總會。
在無數宣教師的熱心事奉及本地傳道人與信徒的積極參與下，長老教會通過醫療、傳道、教育、社會服務等方式，一步步在全台灣各地立下教會的根基，並藉著小會、中會/族群區會、總會的設立，逐漸走向組織化、自主化的階段。
